Idrissa Ouédraogo est né à Banfora, en Haute-Volta (actuelle Burkina Faso), en 1954. Il a grandi dans la ville de Ouahigouya, dans la région septentrionale de son pays, et en 1976, il a obtenu une licence ès lettres. Pour assurer une meilleure vie, ses parents paysans l'ont envoyé à Ouagadougou afin de poursuivre ses études. Il a fréquenté l'Institut Africain d'Études Cinématographiques, où il a complété sa formation en 1981 en obtenant un master. Après avoir étudié à Kiev en URSS, il s'est installé à Paris, où il a été diplômé de l'Institut des hautes études cinématographiques (IDHEC) en 1985 avec un DEA de la Sorbonne. À la sortie de l'IAFEC en 1981, Ouédraogo a créé sa propre société de production cinématographique indépendante, « The Future of Films », qui devint par la suite « Les Films de la Plaine ». En 1981, avant de partir à Kiev, il a travaillé à la Direction de la Production Cinématographique du Burkina Faso, où il a réalisé plusieurs courts-métrages.